FD-001 全流程复盘:双靶点分子胶的端到端能力证明

FD-001 是分迪药业自主研发的双靶点分子胶项目,靶点为 GSPT1 + IKZF1/3,适应症复发难治多发性骨髓瘤(R/R MM)。该项目已通过 NMPA 临床 I 期默示许可,是分迪团队 in-house 完成从设计、合成、生测、CMC 到 IND 申报全流程的代表性成果。

本文按阶段复盘 FD-001 的关键节点与决策。我们希望这篇内容对正在考虑分子胶项目立项、或正在评估「自建 vs 外包」决策的同行有所启发。

立项前的思考(M-2 到 M0)

FD-001 的靶点选择并非临时起意。早在立项前两个月,团队就在反复回答两个问题:

问题 1:为什么是双靶点?

单靶点 GSPT1 类分子胶(代表化合物 CC-885)在 AML 上有过亮眼数据,但因严重造血毒性最终未能成药。而 IKZF1/3 类(lenalidomide、pomalidomide)虽然安全谱友好,对深度耐药 MM 的疗效有限。我们认为,如果有一个分子能同时拉两个降解靶——保留 IMiD 类的安全性、加上 GSPT1 类的强力杀伤——可能解决两类药物各自的短板。

问题 2:双靶点几何上可行吗?

同时降解两个蛋白意味着同一个分子需要在两套 E3-substrate 三元复合物中都形成有效几何。PRODED 平台模块 2 给出预测:存在一类共享 CRBN 结合口袋的小分子骨架,能在 GSPT1 和 IKZF1 两种底物上都形成稳定三元复合物。这给了团队启动信心。

阶段一:发现与优化(Discovery)

这是项目的前置阶段,从靶点立项开始,到提名 PCC(Preclinical Candidate)结束。FD-001 的发现阶段包含以下工作:

  • 虚拟筛选:PRODED 模块 1 输出可降解性评分,确认 GSPT1 + IKZF1/3 同时降解可行;模块 2 进行三元复合物几何采样;从内部 50 万化合物库中筛选出 800 个候选骨架。
  • 首轮合成 + 筛选:合成首批 80 个化合物,HiBiT 一轮筛选,命中 14 个具备初始活性(DC50 < 1 μM)。三元复合物 NanoBRET 验证 4 个分子。
  • SAR 优化:三轮 SAR,累计合成 220+ 化合物,最终确定先导骨架(DC50 < 50 nM、Dmax > 90%)。
  • 体外药效深度评价:降解动力学(t1/2、Dmax)、特异性谱(TMT 全蛋白组学)、细胞活性(MM.1S、OPM-2、NCI-H929)。
  • PCC 提名。

这个发现阶段在分子胶项目中通常需要数月到一年多不等,强烈依赖团队对靶点的前期理解、化合物库储备、计算平台能力以及合成 / 生测的迭代速度。我们不把 FD-001 发现阶段的具体时长当作宣传点——靶点不同、起点不同,节奏差异极大。

阶段二:IND 申报(IND-Enabling)

从 PCC 提名后开始,进入 IND 申报阶段。FD-001 在这一阶段的时间安排如下:

月份 关键工作
M1–M3 API 工艺路线确认、首批 GMP 物料准备、动物 PK 启动(小鼠 IV / PO,F% ~ 35%,t1/2 6 小时)
M2–M5 制剂处方开发(口服胶囊)、稳定性研究启动
M3–M7 GLP 毒理(大鼠 4 周 + 13 周)外包给昭衍执行,我们做项目监督
M5–M7 API 公斤级合成完成
M6–M9 IND 资料同步撰写(eCTD M1–M5 模块)
M9–M10 NMPA Pre-IND 沟通会议(解决起始剂量推荐、特殊安评要求等关键问题)
M10 NMPA 递交
M11 60 天默示许可期满,临床 I 期获批

IND 申报阶段在 FD-001 上耗时约 11 个月。这与行业头部 CRO 的节奏相当,是分子胶项目 IND-Enabling 阶段的标准节奏(通常 10–14 个月范围),不是任何意义上的时间纪录。我们之所以把这个时间公开给读者,是因为它对应一个清晰的事实:整个 IND 申报阶段的工作 in-house 跑通过一次,每一项数据都有内部责任人。

4 个关键决策点

决策 1:选分子胶而非 PROTAC。PROTAC 分子量大(通常 >800 Da)、PK 难度高、口服性差。分子胶分子量小(<500 Da)、成药性更接近常规小分子。在追求口服小分子成药性这个目标下,分子胶是更现实的选择。

决策 2:敢做双靶点。多数公司在第一个分子胶项目上选单靶点,求稳。我们直接做双靶点。这背后的支撑是 PRODED 模块 2 的几何可行性预测——如果没有这个计算工具,我们不敢做。

决策 3:CMC 与药理并行启动。多数 Biotech 在 PCC 提名之后才启动 CMC,这通常增加 2–3 个月的关键路径。我们在 SAR 后期就启动 CMC 工艺评估,避免 CMC 成为后期瓶颈。

决策 4:只把 GLP 外包。GLP 毒理是规模性需求、有刚性硬件要求,必须外包给昭衍 / 华西海圻这类机构。但 CMC、DMPK、生物学评价、IND 撰写全部 in-house。原因不是省钱,是迭代节奏——in-house 团队以日为单位迭代,外包至少周级别。

这个案例对客户的意义

FD-001 项目对 Fendi GlueWorks 作为 CRO 的真正意义,不在于「快」,而在于「全」——五大核心环节由同一支团队跑过一遍,每一环都沉淀了可对外复用的 SOP。如果您正在考虑启动一个分子胶项目,这条 in-house 闭环里我们踩过的坑、做对的决定,都可以以 CRO 服务的方式提供给您。具体服务架构见 服务架构