PRODED™ — Prediction-guided Degrader Engine
PRODED 是分迪药业自研的分子胶发现平台，区别于业内主流的「筛选驱动」思路，我们走的是「源于设计」路线：在湿实验筛选之前，先通过计算预测把命中区间缩到尽可能小，再用 SAR 迭代精化。这套方法学已通过 5 条以上自有管线的实战验证。
核心组成
模块 1 · 靶蛋白可降解性预测（Degradability Prediction）
给定一个新靶蛋白，预测其在不同 E3 系统（CRBN / VHL / cIAP / DCAF15 等）下被降解的概率。
关键创新：融合靶蛋白序列特征 + 亚细胞定位 + 表面赖氨酸暴露度 + 已知降解蛋白训练集，做有监督学习的多输出预测。
当前性能：在内部交叉验证集上，对二分类（可降解 / 不可降解）的预测准确率约 78-83%。
模块 2 · 三元复合物 AI 建模（Ternary Complex Modeling）
预测「靶蛋白 — 分子胶 — E3 连接酶」三元复合物的几何构象，并给出稳定性评分。
关键创新：AI 几何采样作粗筛 + 物理力场作精修的混合算法，比纯分子动力学快两个数量级。
用途：在合成之前预判哪些分子骨架更可能形成有效的三元复合物，避免合成无效化合物浪费时间和钱。
模块 3 · 特异性多肽控制（Specific Peptide Designer）
我们独有的能力。设计能特异性识别特定靶点的短肽序列。
用途：新生抗原（Neoantigen）疫苗、TCR-T 治疗、降解性 ADC（DAC）的 payload 设计。这是 PRODED 平台向分子胶以外领域的延伸应用。
专利布局
- 发明专利 1：可降解性预测方法及系统（已授权）
- 发明专利 2：基于 AI 的三元复合物建模流程（已授权）
- 发明专利 3：特异性多肽设计算法（已授权）
对外开放方式
三个模块对外开放的形式不同：
- 模块 1 → 靶点可降解性快报（9.9 万 / 3 日）
- 模块 2 → 三元复合物预测 API（年度订阅）
- 模块 3 → 特异性多肽设计服务（单项目报价）
验证案例
FD-001：PRODED 平台预测 GSPT1 + IKZF1/3 双靶点可同时降解，指导我们设计出一款已进入 NMPA 临床 I 期的双靶点分子胶，覆盖从设计、合成、生测、CMC 到 IND 申报的完整闭环。详细案例 →